2021年以來，該所加大對國內外油菜、花生、芝麻等油（油行業分析報告）料作物的種質資源收集保存力度，油料作物種質資源庫內新增種質資源7585份，資源增長率在20%以上，資源保存總量增至4.43萬份，居世界第一。同時，發掘出一大批具有高產、高油、抗病、抗逆等多種優良性狀、滿足不同育種需求的優異種質資源，創制出了一批突破性育種材料，為油料作物重大新品種培育和種業穩固發展提供了基礎性、戰略性資源保障。

作為我國唯一的國家級油料專業研究機構，中國農業科學院油料作物研究所近年來提出油菜超高密超高產理論和技術，有望突破油菜單產瓶頸；創制了油菜多性狀快速聚合育種技術體系，育種效率顯著提升，高含油量育種達世界領先水平。該所在全球主導完成甘藍、甘藍型油菜、芝麻等作物全基因組測序與分析工作，合作完成野生花生基因組測序工作，在國際上首次克隆了一批重要性狀功能基因并揭示了相關遺傳機理，創建植物微衛星DNA發掘與應用基礎平臺，為生物育種研究提供了重要的科技支撐。

在育種方面，該所育成短生育期油菜組合20余個，其中“中油早1號”在江西萬安測產，畝產達175.7公斤，比當地主推品種增產26.5%，生育期僅169天，創造了“三熟制”模式下短生育期油菜高產紀錄，破解了南方冬閑田“多熟制”開發利用瓶頸。大豆新品種“中豆63”在山東東營鹽堿地示范畝產達256.6公斤，較全國大豆平均單產水平高出近一倍。高油酸早熟花生新品種“中花215”在湖北襄陽平均畝產達680.03公斤，創長江流域花生高產新紀錄。