長江是中華民族生生不息、永續發展的命脈所系，要毫不動搖地堅持“共抓大保護，不搞大開發”，在高水平保護上下更大功夫，破解“末端截污”到“前端控污”的源頭治理瓶頸，“點源污染”到“面源污染”的綜合治理瓶頸，“干流水清”到“江湖和諧”系統治理瓶頸，“財政投入”到“社會投入”的多元治理瓶頸，打好生態環境鞏固提升持久戰。

生態環境保護是一項長期任務，要堅持精準治污、科學治污、依法治污，逐步化解存量、有效遏制增量，持續打好藍天、碧水、凈土保衛戰。鞏固好長江干流優良水質，推動水環境治理范圍向重要支流和湖泊拓展、治理重點向特征污染物延伸，建立污染治理長效機制。因地制宜補齊城鎮污水收集和處理設施短板，逐步推動城鎮污水管網全覆蓋。注重土壤、地下水污染治理，逐步破解重金屬超標問題，久久為功抓好農業（農業行業分析報告）面源污染治理。

長江是我國重要的生物基因寶庫和生態安全屏障。要科學處理上游江庫、中游江湖、下游江海關系，堅持流域系統治理、綜合治理、源頭治理，實施重要生態系統保護和修復重大工程，破除“局部點穴”、“各掃門前雪”的治理舊習，消除“按下葫蘆浮起瓢”的治理盲區。

以三峽、丹江口水庫等水源區為重點，開展水源涵養和庫濱帶系統治理，加強江河湖庫水系連通建設，保障重要河湖基本生態流量，增強生態系統循環能力、維護生態平衡。要把生物多樣性恢復作為檢驗長江生態環境治理成效的根本標準，實施生物多樣性保護重大工程，全面保護水生生物、珍稀瀕危野生動植物和生物遺傳資源。